这篇文章主要介绍了R语言的immune_bar_plot.r如何使用的相关知识，内容详细易懂，操作简单快捷，具有一定借鉴价值，相信大家阅读完这篇R语言的immune_bar_plot.r如何使用文章都会有所收获，下面我们一起来看看吧。
immune_bar_plot.r 免疫侵润分析bar绘图
使用方法：
计算
安全
数据库
网络和加速
企业服务
$ Rscript immune_bar_plot.r -h
usage: immune_bar_plot.r [-h] -i filepath [-t title]
[-a xlab] [-b ylab]
[-m metadata]
[-g group [group ...]] [-x]
[-o outdir] [-n prefix]
[-H height] [-W width]
immune bar plot
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
-i filepath, --input filepath
input the immune martix [required]
-t title, --title title
input legend tittle name [default cell type]
-a xlab, --xlab xlab input xlab [default sample]
-b ylab, --ylab ylab input ylab [default fraction]
-m metadata, --metadata metadata
input metadata file [default NULL]
-g group [group ...], --group group [group ...]
name of group order [default NULL]
-x, --no.xaxis not show x axis sample name [default False]
-o outdir, --outdir outdir
output file directory [default cwd]
-n prefix, --name prefix
out file name prefix [default demo]
-H height, --height height
the height of pic inches [default 7]
-W width, --width width
the width of pic inches [default 12]参数说明：
使用举例：
#绘制免疫侵润柱状图
Rscript $scriptdir/immune_bar_plot.r -i immu/cibersort.res.tsv -n cibersort.bar \
-o immu --ylab fraction --no.xaxis
#按照分组进行排序
Rscript $scriptdir/immune_bar_plot.r -i immu/cibersort.res.tsv -n cibersort.bar.g \
-m metadata.group.tsv -g subtype.hclust -o immu --ylab fraction --no.xaxis关于“R语言的immune_bar_plot.r如何使用”这篇文章的内容就介绍到这里，感谢各位的阅读！相信大家对“R语言的immune_bar_plot.r如何使用”知识都有一定的了解，大家如果还想学习更多知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道。
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