miRNA数据库在生物信息学领域有着广泛的应用,它们为研究人员提供了一个集中获取和共享miRNA相关信息的平台,从而促进了miRNA研究的进展。以下是miRNA数据库的主要应用场景:
- 功能预测:通过分析miRNA影响的基因来进行功能预测,例如miEAA数据库。
- 表达谱分析:揭示不同生物条件下miRNA的表达变化,结合基因组和转录组数据,进行miRNA-基因调控网络的构建和分析。
- 疾病关联研究:用于miRNA生物标志物的筛选和验证,开发新的诊断和治疗方法,如miRAIDD数据库通过分析PubMed摘要,建立miRNA与疾病因果关系的数据库。
- 靶标预测:预测和验证miRNA的靶基因,如miRDB和DIANA-microT等数据库提供miRNA与目标基因的预测和验证信息。
- 通路分析:利用功能注释信息,进行功能富集分析,预测miRNA的生物功能和参与的信号通路,如miRWalk数据库提供的GSEA富集功能。
miRNA数据库通过提供全面、准确的数据支持,极大地扩展了miRNA研究的广度和深度,为生物学和医学研究提供了强有力的支持。