Linux下Ovito的教程资源有哪些

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小樊

2024-08-28 21:55:04

栏目: 智能运维

Ovito是一款功能强大的原子和分子可视化及分析软件，它支持多种粒子模拟数据的可视化与分析。以下是在Linux下使用Ovito的相关教程和资源：

安装OVITO的Python模块：首先，申请计算资源并加载miniconda3。然后，创建一个新的Python环境，并安装ovito。具体步骤包括：
- srun -n 4 -p cpu --pty /bin/bash：申请计算资源。
- module load miniconda3：加载miniconda3。
- source activate ovito：激活ovito环境。
- conda create -n ovito python=3.8.18：创建新的Python环境。
- conda install --strict-channel-priority -c https://conda.ovito.org -c conda-forge ovito=3.9.4：安装ovito。
运行OVITO的Python模块：在激活的ovito环境中，可以通过命令行运行ovito脚本。例如：
- ovitos --nthreads 40 test.py：使用40线程运行ovito脚本。

基本操作：包括如何导入数据图，使用Expression selection和Invert selection模块进行数据处理，以及导出数据等步骤。
并行使用：在Linux下，Ovito可以通过命令行方式实现并行计算，提高数据处理效率。例如，使用ovitos --nthreads 40 test.py命令可以指定40个线程进行计算。
空间平均作图：如何利用Ovito实现空间平均法，绘制更均匀漂亮的原子云图。

希望这些资源能帮助您更好地在Linux下使用Ovito。如果您在使用过程中遇到任何问题，不妨联系Ovito的官方支持团队获取帮助。

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