RMarkdown是一个用于生成漂亮、可交互的文档的工具，它结合了R代码和Markdown语法，可以生成包含R代码执行结果、图表、表格等内容的文档。RMarkdown可以用于生成报告、教学材料、论文、演示文稿等各种文档。
Shiny是一个基于R语言的Web应用程序框架，可以帮助用户快速构建交互式Web应用程序。使用Shiny，用户可以使用R语言编写后端逻辑，同时使用HTML、CSS和JavaScript构建用户界面。Shiny应用程序可以包含交互式图表、表单、地图等元素，用户可以通过网页浏览器与应用程序进行交互。
综合来看，RMarkdown用于生成静态文档，而Shiny用于构建交互式Web应用程序。用户可以在R语言环境中结合使用这两个工具，生成可视化效果丰富、交互性强的文档和应用程序。
