在Hadoop文件系统（HDFS）中，删除目录的命令是：
```shell
hadoop fs -rm -r
```
或者使用新版本的命令行工具`hdfs`代替`hadoop`：
hdfs dfs -rm -r
这里，`-rm` 表示删除，`-r` 是递归删除的意思，用于删除目录及其下所有文件。`` 需要替换为你想要删除的目录的路径。
