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怎么在python中将nii文件批量转换成png图像

发布时间:2021-02-25 16:11:04 来源:亿速云 阅读:418 作者:戴恩恩 栏目:开发技术

这篇文章主要为大家详细介绍了怎么在python中将nii文件批量转换成png图像,文中示例代码介绍的非常详细,具有一定的参考价值,发现的小伙伴们可以参考一下:

Python主要用来做什么

Python主要应用于:1、Web开发;2、数据科学研究;3、网络爬虫;4、嵌入式应用开发;5、游戏开发;6、桌面应用开发。

import numpy as np
import os    #遍历文件夹
import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包
import imageio   #转换成图像
 
def nii_to_image(niifile):
 filenames = os.listdir(filepath) #读取nii文件夹
 slice_trans = []
 
 for f in filenames:
  #开始读取nii文件
  img_path = os.path.join(filepath, f)
  img = nib.load(img_path)    #读取nii
  img_fdata = img.get_fdata()
  fname = f.replace('.nii','')   #去掉nii的后缀名
  img_f_path = os.path.join(imgfile, fname)
  #创建nii对应的图像的文件夹
  if not os.path.exists(img_f_path):
   os.mkdir(img_f_path)    #新建文件夹
 
  #开始转换为图像
  (x,y,z) = img.shape
  for i in range(z):      #z是图像的序列
   silce = img_fdata[i, :, :]   #选择哪个方向的切片都可以
   imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)), silce)
            #保存图像
 
if __name__ == '__main__':
 filepath = 'nii的文件夹'
 imgfile = 'image的文件夹'
 nii_to_image(filepath)

以上就是亿速云小编为大家收集整理的怎么在python中将nii文件批量转换成png图像,如何觉得亿速云网站的内容还不错,欢迎将亿速云网站推荐给身边好友。

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