小编给大家分享一下如何将.img/.hdr格式转.nii格式,希望大家阅读完这篇文章后大所收获,下面让我们一起去探讨方法吧!
MATLAB转格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).
%%img2nii.m--------------------------------------------
%Script to convert hdr/img files to nii.
%This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later.
%Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014
%select files
f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted');
%convert img files to nii
for i=1:size(f,1)
input = deblank(f(i,:));
[pathstr,fname,ext] = fileparts(input);
output = strcat(fname,'.nii');
V=spm_vol(input);
ima=spm_read_vols(V);
V.fname=output;
spm_write_vol(V,ima);
end
附加一下volume data是如何转surface data的吧…
wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear
补充知识:数据读取——(.img .hdr)
1、定义
该图像格式含有两部分:一个是图像 ‘.img ',另一个是图像头文件 '.hdr',该文件记录了图像的信息,如图像尺寸、波段数、数据类型和大小端等。如果缺少头文件,将无法对图像进行读取,因此头文件十分重要。
2、读取
使用Matlab中NifTi包读取。
eg:
img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')
看完了这篇文章,相信你对如何将.img/.hdr格式转.nii格式有了一定的了解,想了解更多相关知识,欢迎关注亿速云行业资讯频道,感谢各位的阅读!
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