这篇文章主要讲解了“circos中的pattern怎么使用”，文中的讲解内容简单清晰，易于学习与理解，下面请大家跟着小编的思路慢慢深入，一起来研究和学习“circos中的pattern怎么使用”吧！
在官网提供的配置文件示例中，经常会见到pattern这个参数。这个参数的作用和fill_color类似，都用于指定填充的样式，只不过fill_color使用颜色进行填充，pattern则用点和线进行填充。
在hisograms, heatmap，links这3种block 中，可以使用pattern参数，指定填充的样式，用法如下：
pattern = checker
pattern参数的取值范围包括以下9种：
solid
hline
hline-sparse
vline
vline-sparse
checker
checker-sparse
dot
dot-sparse
在软件的安装目录下的etc/patterns.conf中，保存了pattern的配置信息
在tiles目录下，可以找到每种样式对应的图片。根据名字，可以把分成以下5大类别
hlines :
hlines-sparse :
vlines :
vline-sparse:
checkers :
checkers-sparse:
dots :
dots-sparse :
solid代表完全填充，hlines代表水平线填充，vlines代表竖线填充，checker代表格子填充，dots代表用点填充；加上sparse后缀，相比不加后缀时，会稀疏一点。
pattern默认的样式都是白底黑字，可以结合color属性来改变其颜色。有以下两种写法：
示例
color = red
pattern = hlines
此时白色的背景依然不会变，但是默认的黑色的字体会替换成红色
示例
color = white:red,black:orange
冒号分隔的两个颜色代表替换的意思，white:red表示将默认的白色背景替换成红色，black:orange代表将黑色替换成橙色。
结合pattern和color, 可以使得填充更加的多元化。看一个例子
对应的配置文件为
<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>> <<include ideogram.conf>> <<include ticks.conf>> karyotype = data/karyotype/karyotype.human.txt <image> <<include etc/image.conf>> </image> chromosomes_units = 1000000 chromosomes_display_default = yes <links> <link> file = data/8/15/links.txt ribbon = yes flat = yes radius = 0.95r bezier_radius = 0r crest = 0.2 <rules> <rule> condition = rand() < 0.5 pattern = eval((qw(hline vline checker dot))[rand(4)]) color = black:dblue,white:vlblue z = 10 </rule> <rule> condition = rand() < 0.5 pattern = eval((qw(hline vline checker dot))[rand(4)]) z = 5 </rule> </rules> </link> </links> <<include etc/housekeeping.conf>>
感谢各位的阅读，以上就是“circos中的pattern怎么使用”的内容了，经过本文的学习后，相信大家对circos中的pattern怎么使用这一问题有了更深刻的体会，具体使用情况还需要大家实践验证。这里是亿速云，小编将为大家推送更多相关知识点的文章，欢迎关注！
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