这篇文章将为大家详细讲解有关lncRNASNP数据库有什么用，小编觉得挺实用的，因此分享给大家做个参考，希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。
lncRNASNP数据库收集整理了人和小鼠中位于lncRNA基因上的SNP位点信息，通过以下两种思路将lncRNA与SNP结合起来
探究SNP位点对于lncRNA结构的影响
分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响
除此之外，还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息，比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱，SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库的网址如下
http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP2
对于一个lncRNA, 包含了以下几种信息
包含以下3种来源的SNP位点
dbsnp
TCGA
Cosmic
以dbsnp数据库为例，结果示意如下
包含lncDisease数据库中提供的实验证据支持的相关疾病和使用TAM软件预测的信息，示意如下
采用软件预测lncRNA与miRNA结合区域信息，一个lncRNA会存在多个miRNA结合位点，示意如下
点击每个miRNA，可以看到软件预测的详细结果
采用了Pita, MiRanda, TargetScan3款软件进行预测。
包括以下两种影响
gain
loss
gain指的是原本lncRNA与miRNA没有结合位点，突变之后的lncRNA与miRNA存在结合位点，loss则与之相反，示意如下
采用柱状图的形式展示在不同肿瘤中的表达谱数据，示意如下
官网还提供了在线工具，可以分析突变位点对于lncRNA-miRNA结合的影响以及SNP对于lncRNA二级结构的影响，如下所述
只需要输入lncRNA的野生型序列和突变型序列，采用上述的3种软件预测miRNA与两种序列的结合位点，从而分析突变对于lncRNA-miRNA结合的影响，示意如下
采用RNAsnp软件预测snp位点对于lncRNA二级结构的影响，示意如下
官网还提供了很多的功能，具体用法请移步官网自行探究。
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