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circRNADisease数据库怎么用

发布时间:2022-01-15 17:43:44 来源:亿速云 阅读:224 作者:小新 栏目:大数据

小编给大家分享一下circRNADisease数据库怎么用,相信大部分人都还不怎么了解,因此分享这篇文章给大家参考一下,希望大家阅读完这篇文章后大有收获,下面让我们一起去了解一下吧!

circRNA在生命活动中发挥着调控作用,在肿瘤等疾病中更是扮演着重要角色。circRNADisease是一个手工整理的疾病相关的环状RNA数据库,网址如下

http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/

目前该数据库中收录了330个circRNA,48种疾病,354个circRNA和疾病之间的关联数据。通过导航栏的Browser菜单,可以根据以下两种类型查看相关数据

  1. circRNAs

  2. Diseases


以肺癌为例,结果如下所示

circRNADisease数据库怎么用

该数据库中的环状RNA包括circBase id和circRNA name两种,对于每个环状RNA和疾病的关联数据,给出了检测的方式,环状RNA在患病者中的表达趋势,相关文献的pubmed id,点击details可以查看详细信息

1. circRNA  basic information

circRNADisease数据库怎么用

2. disease basic information

circRNADisease数据库怎么用

3. other information

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通过该数据库,可以方便得到已经报导的环状RNA与疾病的关联数据。值得一提的是,所谓的环状RNA与疾病的关联,其实就是检测相比正常组织,患者组织中差异表达的环状RNA,方法包括转录组测序,芯片,qPCR等手段,只是一种简单的关联,并没有深入挖掘circRNA在疾病中的具体作用。

以上是“circRNADisease数据库怎么用”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注亿速云行业资讯频道!

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