本篇内容介绍了“JBrowse安装配置的步骤”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!
我用的是阿里云服务器Ubuntu系统
按照 JBrowse使用说明:如何安装JBrowse这篇教程中的步骤进行安装 用到的命令是
sudo mkdir /var/www/jbrowse
sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse
cd /var/www/jbrowse
# unzip it and cd into it
unzip JBrowse-1.16.9.zip
cd JBrowse-1.16.9
# run setup.sh, quick start with example data
./setup.sh
这里需要注意的是sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse
这行命令里 不是单引号,而是ESC键下面那个
./setup.sh
这一步会运行好长时间,因为需要安装好多依赖的perl模块,这里吐槽一下perl模块的安装好麻烦,或者是我自己没有掌握正确的安装方法吧!
我的nginx已经安装好了 在自己的电脑浏览器输入http://123.56.89.209/jbrowse/JBrowse-1.16.9/index.html?data=sample_data/json/volvox
报错
暂时还不知道是什么原因
然后我将 /var/www/html/
目录下的index.nginx-debian.html
文件删除掉了(记得备份),然后将 /var/www//jbrowse/JBrowse-1.16.9/
目录下的所有内容都复制到了/var/www/html/
目录下
cp -R ../jbrowse/JBrowse-1.16.9/* ./
然后在自己本地电脑浏览器输入http://123.56.89.209/index.html?data=sample_data/json/volvox
终于看到了结果
“JBrowse安装配置的步骤”的内容就介绍到这里了,感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注亿速云网站,小编将为大家输出更多高质量的实用文章!
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