miRNA合成及miRNA命名的方法

本篇内容介绍了“miRNA合成及miRNA命名的方法”的有关知识，在实际案例的操作过程中，不少人都会遇到这样的困境，接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧！希望大家仔细阅读，能够学有所成！

miRNA合成过程，以及miRNA命名方式，编号规则

        MicroRNA （miRNA） 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。据推测，miRNA调节着人类三分之一的基因。最近的研究表明大约70 %的哺乳动物miRNA 是位于TUs区( transcriptionunits , TUs )  , 且其中大部分是位于内含子区 。一些内含子miRNA 的位置在不同的物种中是高度保守的。miRNA 不仅在基因位置上保守, 序列上也呈现出高度的同源性 。miRNA 高度的保守性与其功能的重要性有着密切的关系。miRNA 与其靶基因的进化有着密切的联系, 研究其进化历史有助于进一步了解其作用机制和功能。

miRNA的生物合成

miRNA是一种小的、内源性的、长度为20-24个核苷酸的单链RNA，由发夹状初始转录产物经过加工后形成，它的序列存在于发夹状茎环结构中的茎上。

在动物中，miRNA基因在RNA聚合酶II的作用下转录生成miRNA初级转录产物primary miRNA（pri-miRNA），pri-miRNA在细胞核内被Drosha蛋白加工为miRNA前体precursor miRNA（pre-miRNA），pre-miRNA在exportin-5的介导下运输到胞浆，在细胞质中进一步由dicer酶加工为成熟的miRNA。

miRNA的5p和3p

     有的miRNA前体两个臂分别产生一条有功能的成熟miRNA，他们分别靶向不同的位点。这时候就要来进行区分，一般以“-5p”和“-3p”分别命名。如hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p，分别表明从hsa-mir-21前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。

miRNA命名

1) miRNA成熟体命名规则(以动物miRNA为例：

    ①确定命名规则之前发现的miRNA，则保留原来名字，如hsa-let-7

    ②miRNA成熟体简写成miR，再根据其物种名称，及被发现的先后顺序加上阿拉伯数字，如hsa-miR-122

    ③高度同源的miRNA在数字后机上英文小写字母(a,b,c,…)，如hsa-miR-34a，hsa-miR-34b，hsa-miR-34c等

    ④由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA，则在后面机上阿拉伯数字以示区分，如hsa-miR-199a-1和hsa-miR-199a-2

    ⑤通常一个miRNA前体长度大约为70~80nt，很可能两个臂分别产生miRNA：如果没有明显的表达差异，则以“-5p”和“-3p”分别命名。如hsa-miR-26b-5p和hsa-miR-26b-3p，分别表明从hsa-mir-26b前体的5’端臂和3’端臂加工而来的

2）miRNA编号

① miRNA前体

    发夹状结构的miRNA前体转录本以“mir”命名，其编号以“MI”编号，如人的miRNA 122的前体ID为hsa-mir-122，Accession为MI0000442

② miRNA成熟体
    大约20～23nt的miRNA成熟体以“miR”命名，其编号以“MIMAT”编号，如人的miR-122有两个成熟体，其中之一ID为hsa-miR-122-5p ，Accession为 MIMAT0000421;另一个为ID为hsa-miR-122-3p ，Accession为 MIMAT000 4590

“miRNA合成及miRNA命名的方法”的内容就介绍到这里了，感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注亿速云网站，小编将为大家输出更多高质量的实用文章！