这篇文章给大家介绍在线工具TIMER如何使用,内容非常详细,感兴趣的小伙伴们可以参考借鉴,希望对大家能有所帮助。
在线工具TIMER功能及使用
TIMER是用于肿瘤浸润性免疫细胞综合分析的在线工具,通过TIMER算法估计六种免疫浸润细胞(B细胞,CD4+T细胞,CD8+T细胞,中性粒细胞,巨噬细胞和树突状细胞)的丰度,其中:
Gene 模块探索基因表达 与免疫浸润丰度之间的相关性 ;
选择癌症类型,免疫细胞类型,输入基因symbol之后就可以进行分析。
Survival 模块探索临床结果 与免疫浸润或基因表达丰度之间的关联 ;
Mutation 模块探索突变基因 与免疫浸润丰度之间的相关性 ;
SCNA 模块探索基因拷贝变异数与免疫浸润丰度之间相关性 ;
Diff Exp 模块探索 肿瘤与正常组织之间的差异基因表达;
Correlation 模块探索 基因之间的相关性 ;
Estimation 模块通过 TIMER 算法运行用户的私有样本。
关于在线工具TIMER如何使用就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,可以学到更多知识。如果觉得文章不错,可以把它分享出去让更多的人看到。
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