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avereps怎么按照相同ID取均值

发布时间:2022-03-18 14:28:13 来源:亿速云 阅读:582 作者:iii 栏目:开发技术

本篇内容主要讲解“avereps怎么按照相同ID取均值”,感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷,实用性强。下面就让小编来带大家学习“avereps怎么按照相同ID取均值”吧!

aggregate可以对数据分组处理

limma包提供一个函数avereps可以对相同ID的数据取均值,识别的输入数据可以是matrix,MAList或者EList,后两者涉及芯片数据标准化过程,此处仅介绍如何针对matrix数据进行处理。

指定数据如下:相同type取均值

> dat
   type Num1 Num2
1     A   90   89
2     B   34   32
3     C   56   53
4     D   99   95
5     E   15   10
6     A   50   44
7     B   20   13
8     C   24   16
9     D   70   61
10    E   14    4

对数据除type列所有数据,按照type分类ID,取均值,结果:

> avereps(dat[,-1],ID=dat$type)
  Num1 Num2
A 70.0 66.5
B 27.0 22.5
C 40.0 34.5
D 84.5 78.0
E 14.5  7.0

到此,相信大家对“avereps怎么按照相同ID取均值”有了更深的了解,不妨来实际操作一番吧!这里是亿速云网站,更多相关内容可以进入相关频道进行查询,关注我们,继续学习!

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