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TCGA临床信息如何正确的保存格式, 避免错行，错列的情况
TCGA的临床数据，经过TCGAbiolinks 下载之后，需要保存到文件中，一般大家都希望保存的文件能够采用excel 打开。
但是临床数据中存在几个问题：
1. 一些值缺失，没有值填充
2， 一些字段中存在空格，逗号等
如果直接采用R中的 write.table进行读写，经常会存在数据错行，字段错列的情况,主要的原因是该函数默认采用tab格式 ：“\t” 进行数据分割，而excel 无法区分 空格和tab。
这就需要采用一个临床信息中没有的分隔符，对数据进行分割 ，比如，采用星号（*）去分割。
# 将数据保存到文件 clinical_file <- paste0(DataDirectory, "_","clinical",".txt") write.table(clinical, file = clinical_file, row.names = F, col.names=T,quote = T,sep='*',na = "NA")
之后打开excel 时，对数据进行分列，同样选用星号（*） 即可。
以上是“TCGA临床信息如何正确的保存格式”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家都有了一定的了解，希望分享的内容对大家有所帮助，如果还想学习更多知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道！
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