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Pacbio Sequel下机数据的示例分析

发布时间:2022-03-19 10:16:56 来源:亿速云 阅读:380 作者:小新 栏目:开发技术

这篇文章将为大家详细讲解有关Pacbio Sequel下机数据的示例分析,小编觉得挺实用的,因此分享给大家做个参考,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。

Pacbio Sequel 下机数据介绍

Pacbio Sequel 下机数据, 一般包括如下几个数据:

m54134_180724_220656.scraps.bam
m54134_180724_220656.subreads.bam
m54134_180724_220656.scraps.bam.pbi
m54134_180724_220656.subreads.bam.pbi
m54134_180724_220656.baz2bam_1.log
m54134_180724_220656.sts.xml
m54134_180724_220656.subreadset.xml
m54134_180724_220656.transferdone
m54134_180724_220656.adapters.fasta

文件的名称是有固定的编码形式的,以上面的数据为例:

m54134_180724_220656.subreads.bam
其中:

m: 是movie 的缩写

54134: 是设备的编号

180724_220656: 是测序运行的开始时间,为2018年07月24日22时06分56秒

subreads: 这部分是不同的数据类型,一般有scraps, subreads等

bam: 这是数据的格式,一般有bam格式,xml,fasta格式等

关于“Pacbio Sequel下机数据的示例分析”这篇文章就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,使各位可以学到更多知识,如果觉得文章不错,请把它分享出去让更多的人看到。

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