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虚拟机中如何快速获取多条序列长度信息

发布时间:2022-03-10 11:01:24 来源:亿速云 阅读:331 作者:小新 栏目:开发技术

这篇文章主要介绍了虚拟机中如何快速获取多条序列长度信息,具有一定借鉴价值,感兴趣的朋友可以参考下,希望大家阅读完这篇文章之后大有收获,下面让小编带着大家一起了解一下。

如何快速知道你的多个序列的长度呢?这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具,samtools。命令行格式:samtools faidx   xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件,也是就是在你的序列文件名后面多了一个fai,文件合适如下:

211000022280750 9865 142631474 60 61
211000022280526 9368 142641578 60 61
211000022279869 9341 142651177 60 61
211000022278215 8346 142660748 60 61
211000022279695 8007 142669308 60 61
211000022279735 7722 142677523 60 61
211000022280490 7314 142685448 60 61
211000022280465 7123 142692958 60 61
211000022280734 7003 142700274 60 61
211000022278032 6936 142707468 60 61
211000022280476 6900 142714594 60 61
211000022280735 6860 142721683 60 61
211000022279018 6860 142728732 60 61
211000022280699 6825 142735781 60 61

感谢你能够认真阅读完这篇文章,希望小编分享的“虚拟机中如何快速获取多条序列长度信息”这篇文章对大家有帮助,同时也希望大家多多支持亿速云,关注亿速云行业资讯频道,更多相关知识等着你来学习!

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