温馨提示×

温馨提示×

您好,登录后才能下订单哦!

密码登录×
登录注册×
其他方式登录
点击 登录注册 即表示同意《亿速云用户服务条款》

如何使用Perl脚本得到反向互补序列

发布时间:2022-02-23 10:59:05 来源:亿速云 阅读:572 作者:小新 栏目:开发技术

这篇文章将为大家详细讲解有关如何使用Perl脚本得到反向互补序列,小编觉得挺实用的,因此分享给大家做个参考,希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获。

Perl脚本求得反向互补序列函数如下:

sub reverse_complement_IUPAC {
        my $dna = shift;
        # reverse the DNA sequence
        my $revcomp = reverse($dna);
        # complement the reversed DNA sequence
        $revcomp =~ tr/ABCDGHMNRSTUVWXYabcdghmnrstuvwxy/TVGHCDKNYSAABWXRtvghcdknysaabwxr/;
        return $revcomp;
}
sub reverse_complement {
        my $dna = shift;
        # reverse the DNA sequence
        my $revcomp = reverse($dna);
        # complement the reversed DNA sequence
        $revcomp =~ tr/ACGTacgt/TGCAtgca/;
        return $revcomp;
}

用法,以reverse_complement 为例:

$str = &reverse_complement($a);

#$a变量里存放序列字符串,$str为求得的反向互补序列。

关于“如何使用Perl脚本得到反向互补序列”这篇文章就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,使各位可以学到更多知识,如果觉得文章不错,请把它分享出去让更多的人看到。

向AI问一下细节

免责声明:本站发布的内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场,如果涉及侵权请联系站长邮箱:is@yisu.com进行举报,并提供相关证据,一经查实,将立刻删除涉嫌侵权内容。

AI