今天小编给大家分享一下怎么从TCGA数据库中下载指定类型样本的数据的相关知识点，内容详细，逻辑清晰，相信大部分人都还太了解这方面的知识，所以分享这篇文章给大家参考一下，希望大家阅读完这篇文章后有所收获，下面我们一起来了解一下吧。
其实可以用TCGAbiolinks 软件包中的GDCquery 函数，指定sample.type 去筛选样本。
比如：需要下载实体瘤组织的样本，那么指定sample.type 为 “Primary solid Tumor”即可：
计算
安全
数据库
网络和加速
企业服务
query <- GDCquery(project = "TCGA-LGG",
legacy = TRUE,
data.category = "Gene expression",
data.type = "Gene expression quantification",
platform = "Illumina HiSeq",
file.type = "results",
experimental.strategy = "RNA-Seq", sample.type = "Primary solid Tumor")以上就是“怎么从TCGA数据库中下载指定类型样本的数据”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家阅读完这篇文章都有很大的收获，小编每天都会为大家更新不同的知识，如果还想学习更多的知识，请关注亿速云行业资讯频道。
亿速云「云数据库 MySQL」免部署即开即用，比自行安装部署数据库高出1倍以上的性能，双节点冗余防止单节点故障，数据自动定期备份随时恢复。点击查看>>
免责声明：本站发布的内容（图片、视频和文字）以原创、转载和分享为主，文章观点不代表本网站立场，如果涉及侵权请联系站长邮箱：is@yisu.com进行举报，并提供相关证据，一经查实，将立刻删除涉嫌侵权内容。
