今天小编给大家分享一下怎么从TCGA数据库中下载指定类型样本的数据的相关知识点，内容详细，逻辑清晰，相信大部分人都还太了解这方面的知识，所以分享这篇文章给大家参考一下，希望大家阅读完这篇文章后有所收获，下面我们一起来了解一下吧。
其实可以用TCGAbiolinks 软件包中的GDCquery 函数，指定sample.type 去筛选样本。
比如：需要下载实体瘤组织的样本，那么指定sample.type 为 “Primary solid Tumor”即可：
query <- GDCquery(project = "TCGA-LGG", legacy = TRUE, data.category = "Gene expression", data.type = "Gene expression quantification", platform = "Illumina HiSeq", file.type = "results", experimental.strategy = "RNA-Seq", sample.type = "Primary solid Tumor")
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