在Docker容器中运行Java应用时，可以通过以下方式来处理内存和CPU限制问题：
使用Docker命令行参数：可以使用Docker命令行参数来设置容器的内存和CPU限制。例如，可以使用-m参数来设置容器的内存限制，使用--cpus参数来设置容器的CPU限制。
使用Docker Compose：如果使用Docker Compose来管理多个容器，可以在docker-compose.yml文件中设置容器的内存和CPU限制。可以使用mem_limit参数来设置内存限制，使用cpu_shares参数来设置CPU限制。
使用Docker Swarm：如果使用Docker Swarm来管理多个容器，可以在service配置中设置容器的内存和CPU限制。可以使用--limit-memory参数来设置内存限制，使用--limit-cpu参数来设置CPU限制。
使用Docker资源限制插件：有一些第三方的Docker插件可以帮助更精细地设置容器的资源限制，例如docker-cgroup插件。
总的来说，可以通过Docker的内置功能或者第三方插件来设置容器的内存和CPU限制，以确保Java应用在容器中能够正常运行并且不会消耗过多的系统资源。
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