在使用PHPDocumentor文档化代码时，需要考虑以下安全性问题：
敏感信息保护：在文档化代码时，需要注意不要包含敏感信息，比如数据库连接信息、密码等。确保只公开需要公开的信息。
防止代码注入：在文档中插入代码片段时，需要确保这些代码片段是经过安全检查的，避免恶意代码注入。
文件上传安全：如果文档中包含上传的文件，需要确保文件上传功能是安全的，避免文件上传漏洞。
定期更新：及时更新PHPDocumentor和相关依赖库，确保代码文档化工具是最新版本，以减少安全漏洞的风险。
限制访问权限：确保只有授权的用户能够访问生成的文档，避免敏感信息泄露。
使用安全连接：在生成和查看文档时，最好使用HTTPS连接，确保传输过程中的数据安全。
通过以上安全性考虑，可以有效保护代码文档化过程中的安全性。
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