miRNA数据库的数据存储结构是一个复杂且精细的系统,它涉及到多个层次和组成部分,以确保数据的完整性、可访问性和高效性。以下是miRNA数据库数据存储结构的相关信息:
数据库的逻辑存储结构
- 数据块:数据库块是数据库使用的I/O最小单元,由一个或多个物理块组成。在Oracle数据库中,块的大小由参数DB_BLOCK_SIZE确定,且是操作系统块大小的整数倍。
- 区:区是由一系列连续的数据块构成的逻辑存储单元,是存储空间分配的最小单元。
- 段:段是由一个或多个区组成的逻辑存储单元,用于存储特定的、具有独立存储结构的数据库对象。常见的段类型包括数据段、索引段、回滚段等。
- 表空间:表空间是数据库中最大的逻辑存储单元,包含一个或多个数据文件。数据库的大小从逻辑上看就是由表空间决定的。
数据库的物理存储结构
- 数据文件:存储数据库数据的文件,每个数据文件只与一个数据库相联系。
- 控制文件:记录数据库结构信息的重要的二进制文件,描述数据库的物理文件映射到数据字典中的逻辑表格空间和联机重做日志文件。
- 重做日志文件:记录所有对数据库数据的修改,以备恢复数据时使用。
- 归档日志文件:重做日志文件的历史备份,用于数据恢复[5]。
特定miRNA数据库的存储结构特点
- miRBase:作为miRNA研究领域内最权威的数据库之一,miRBase提供了miRNAs序列以及注释,定位,发卡序列等信息,以及提供命名服务。miRBase的存储结构包括了前体miRNA和成熟miRNA的序列信息,这些信息以FASTA格式存储,便于进行序列比对和分析。
通过上述分析,我们可以看到miRNA数据库的数据存储结构是一个多层次的系统,它结合了逻辑存储结构和物理存储结构的优点,以支持大规模、高效的数据管理和分析。