在Flask应用中配置SQLAlchemy的方法如下：
from flask_sqlalchemy import SQLAlchemy
app = Flask(__name__)
app.config['SQLALCHEMY_DATABASE_URI'] = 'sqlite:///test.db' # 数据库连接URI
db = SQLAlchemy(app)
在Flask应用的配置中添加数据库连接信息，如上述的SQLALCHEMY_DATABASE_URI。可以根据不同的数据库类型（如SQLite, MySQL, PostgreSQL等）设置不同的连接URI。
创建数据库模型类，并使用SQLAlchemy的db.Model作为基类：
class User(db.Model):
id = db.Column(db.Integer, primary_key=True)
username = db.Column(db.String(80), unique=True, nullable=False)
app.py中添加数据库的初始化和创建数据表的代码：from app import db
db.create_all()
通过以上步骤就可以成功配置Flask应用中的SQLAlchemy，并创建数据库和数据表。
