PyStan 为 Stan 提供了一个 Python 接口,这是一个使用 No-U-Turn 采样器进行贝叶斯推理的软件包,这是Hamiltonian Monte Carlo 的一种变体。
PyStan具有以下依赖项:
Python:2.7,> = 3.3
Cython:> = 0.22
NumPy:> = 1.7
PyStan还要求在安装和运行时可以使用C ++编译器。 在基于Debian的系统上,这是通过发出命令apt-get install build-essential来完成的。
例子:
import pystan
schools_code = """
data {
int<lower=0> J; // number of schools
vector[J] y; // estimated treatment effects
vector<lower=0>[J] sigma; // s.e. of effect estimates
}
parameters {
real mu;
real<lower=0> tau;
vector[J] eta;
}
transformed parameters {
vector[J] theta;
theta = mu + tau * eta;
}
model {
eta ~ normal(0, 1);
y ~ normal(theta, sigma);
}
"""schools_dat = {'J': 8, 'y': [28, 8, -3, 7, -1, 1, 18, 12], 'sigma': [15, 10, 16, 11, 9, 11, 10, 18]}
sm = pystan.StanModel(model_code=schools_code)
fit = sm.sampling(data=schools_dat, iter=1000, chains=4)
需要资料,看个简介
素材来源中:开源中国
亿速云「云服务器」,即开即用、新一代英特尔至强铂金CPU、三副本存储NVMe SSD云盘,价格低至29元/月。点击查看>>
免责声明:本站发布的内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场,如果涉及侵权请联系站长邮箱:is@yisu.com进行举报,并提供相关证据,一经查实,将立刻删除涉嫌侵权内容。
原文链接:http://blog.itpub.net/69912078/viewspace-2637826/