这篇文章主要介绍了blastall中的文件格式有哪些的相关知识,内容详细易懂,操作简单快捷,具有一定借鉴价值,相信大家阅读完这篇blastall中的文件格式有哪些文章都会有所收获,下面我们一起来看看吧。
1、Query id:查询序列ID标识
2、Subject id:比对上的目标序列ID标识
3、% identity:序列比对的一致性百分比
4、alignment length:符合比对的比对区域的长度
5、mismatches:比对区域的错配数
6、gap openings:比对区域的gap数目
7、q. start:比对区域在查询序列(Query id)上的起始位点
8、q. end:比对区域在查询序列(Query id)上的终止位点
9、s. start:比对区域在目标序列(Subject id)上的起始位点
10、s. end:比对区域在目标序列(Subject id)上的终止位点
11、e-value:比对结果的期望值,解释是大概多少次随即比对才能出现一次这个score,Evalue越小,表明这种情况从概率上越不可能发生,那么发生了即说明这更有可能是真实的相似序列
12、bit score:比对结果的bit score值
一般情况我们看第3、11、12两列,e值越小越可靠。
blast对应的参数是 -m 8
blast+对应的参数是-outfmt 6
关于“blastall中的文件格式有哪些”这篇文章的内容就介绍到这里,感谢各位的阅读!相信大家对“blastall中的文件格式有哪些”知识都有一定的了解,大家如果还想学习更多知识,欢迎关注亿速云行业资讯频道。
免责声明:本站发布的内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场,如果涉及侵权请联系站长邮箱:is@yisu.com进行举报,并提供相关证据,一经查实,将立刻删除涉嫌侵权内容。