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iTOL怎么为进化树外层添加圆环

发布时间:2022-03-19 13:44:05 来源:亿速云 阅读:3353 作者:iii 栏目:开发技术

这篇“iTOL怎么为进化树外层添加圆环”文章的知识点大部分人都不太理解,所以小编给大家总结了以下内容,内容详细,步骤清晰,具有一定的借鉴价值,希望大家阅读完这篇文章能有所收获,下面我们一起来看看这篇“iTOL怎么为进化树外层添加圆环”文章吧。

首先准备好进化树。

然后准备注释文件,其格式如下:

DATASET_COLORSTRIP
#lines starting with a hash are comments and ignored during parsing
#select the separator which is used to delimit the data below (TAB,SPACE or COMMA).This separator must be used throught this file (except in the SEPARATOR line, which uses space).
#SEPARATOR TAB
SEPARATOR SPACE
#SEPARATOR COMMA
#label is used in the legend table (can be changed later)
DATASET_LABEL color_strip2
#dataset color (can be changed later)
COLOR #ff0000
#optional settings
#all other optional settings can be set or changed later in the web interface (under 'Datasets' tab)
#maximum width
STRIP_WIDTH 25
#left margin, used to increase/decrease the spacing to the next dataset. Can be negative, causing datasets to overlap.
MARGIN 0
#border width; if set above 0, a black border of specified width (in pixels) will be drawn around the color strip 
BORDER_WIDTH 1
BORDER_COLOR #000
#show internal values; if set, values associated to internal nodes will be displayed even if these nodes are not collapsed. It could cause overlapping in the dataset display.
SHOW_INTERNAL 0
#In colored strip charts, each ID is associated to a color. Color can be specified in hexadecimal, RGB or RGBA notation
#Internal tree nodes can be specified using IDs directly, or using the 'last common ancestor' method described in iTOL help pages
#Actual data follows after the "DATA" keyword
DATA
#ID1 value1
#ID2 value2
160232 #efff22 COL#efff22
13773 #efff22 COL#efff22
56636 #efff22 COL#efff22
111955 #efff22 COL#efff22
2287 #efff22 COL#efff22
50339 #efff22 COL#efff22
2303 #efff22 COL#efff22
2234 #efff22 COL#efff22

DATA之前的部分都是格式声明,照抄即可。之后就是添加圆环数据,数据分两列,第一列为原始标签,第二列是圆环对应颜色,之间以Ta空格分隔。准备好数据后就可以加到进化树中了。

以上就是关于“iTOL怎么为进化树外层添加圆环”这篇文章的内容,相信大家都有了一定的了解,希望小编分享的内容对大家有帮助,若想了解更多相关的知识内容,请关注亿速云行业资讯频道。

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