今天小编给大家分享一下IsoSeq3怎么安装的相关知识点，内容详细，逻辑清晰，相信大部分人都还太了解这方面的知识，所以分享这篇文章给大家参考一下，希望大家阅读完这篇文章后有所收获，下面我们一起来了解一下吧。
参考官方的安装说明，采用Anaconda 进行安装，步骤如下：
1 下载最新版本的Anaconda
2 参考安装说明，安装Anaconda。并将Anaconda的bin目录加入到系统PATH环境变量
3 测试conda是否安装成功，并更新到最新版本
conda -V conda update conda
4 创建一个虚拟环境,命名为anaCogent5.2(这个名字可以自己定义），采用python 2.7版本
conda create -n anaCogent5.2 python=2.7 anaconda source activate anaCogent5.2
5 配置国内镜像，加快软件安装速度
有时候，安装这些包的速度比较慢，还可能中断，主要原因是Anaconda的服务器在国外。可以换成国内的镜像，加快下载速度。目前清华大学那边提供了镜像，其配置方法如下：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ conda config --set show_channel_urls yes
6 安装依赖包biopython bx-python
conda install -n anaCogent5.2 biopython conda install -n anaCogent5.2 -c http://conda.anaconda.org/cgat bx-python
7 安装iso-Seq3 和 LIMA
conda install -n anaCogent5.2 -c bioconda isoseq3 conda install -n anaCogent5.2 -c bioconda bamtools conda install -n anaCogent5.2 -c bioconda pysam
以上就是“IsoSeq3怎么安装”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家阅读完这篇文章都有很大的收获，小编每天都会为大家更新不同的知识，如果还想学习更多的知识，请关注亿速云行业资讯频道。
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