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R语言怎么实现超几何分布

发布时间:2022-03-18 17:12:45 来源:亿速云 阅读:746 作者:iii 栏目:开发技术

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超几何分布的R实现

超几何分布是统计学中的一种离散分布,它描述了由有限个物件中抽出n个物件,成功抽出指定种类的物件的个数。 也是生物信息学中常用的一种统计分布模型。我们在GO,KEGG的富集分析时就采用的是这个模型。 其数学表达式如下:
R语言怎么实现超几何分布

其中:

N: 总样本数

m: 总样本中“特定类别”的数量

n: 从总样本中随机抽取的数量

k: 抽取样本中属于“特定类别”的数量

但是我们做统计模型时,统计不是分布概率,而是累积概率,所以计算的p_value 值计算公式为:

对应的R代码实现为:

1-phyper(k-1,m, N-m, n,)

到此,相信大家对“R语言怎么实现超几何分布”有了更深的了解,不妨来实际操作一番吧!这里是亿速云网站,更多相关内容可以进入相关频道进行查询,关注我们,继续学习!

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