这篇文章主要讲解了“circos images怎么使用”,文中的讲解内容简单清晰,易于学习与理解,下面请大家跟着小编的思路慢慢深入,一起来研究和学习“circos images怎么使用”吧!
image
这个block是circos内置的block
之一,其配置文件为软件安装目录下的etc/image.conf
。内容为
默认的image
的配置由两个文件决定
image.generic.conf
background.white.conf
image.generic.conf
文件内容如下
包含以下几个属性
dirdir
指定生成的图片的目录,.
代表当前目录
filefile
指定生成的图片的名字,默认为circos.png
pngpng
指定生成的图片的格式,yes
代表生成png格式的图片
svg
svg
指定生成的图片的格式,yes
代表生成svg格式的图片
radiusradius
指定图片半径的大小,由于circos
是圆形布局,所以用圆的半径来控制图片大小,生成的图片是正方形的,边长为2 * radius
angle_offsetangle_offset
指定起始染色体的偏移角度,默认起始的角度为0
度,对应表盘上3点钟位置,angle_offset = -90
, 第一条染色体位于表盘上12点钟位置,
auto_alpha_colorsauto_alpha_colors
代笔对颜色添加透明度,在原来RGB颜色的基础上,添加一个alpha透明度属性,
auto_alpha_stepauto_alpha_step
指定透明度的大小,取值范围0-100, 默认值为5
background.white.conf
文件只有一行内容
background = white
指定生成的图片的背景色,可以看到这里为白色,所以默认生成的图片背景色都为白色。
在使用时,我们通常只调用系统内置的image
的配置文件就可以了,写法如下
此时image
的相关配置就是系统默认配置,当我们想要改变其中某项默认配置时,比如修改背景色为黑色,需要使用*
操作符,示例如下
在想要修改的参数后面添加*
, 然后重新赋值即可。
对于background
, 有两点需要注意
写法如下
background = transparent
写法如下:
background = background.png
要求背景图片的格式必须为png
,而且大小必须和输出图片的大小完全一致。
最后看一个更换背景色的例子
感谢各位的阅读,以上就是“circos images怎么使用”的内容了,经过本文的学习后,相信大家对circos images怎么使用这一问题有了更深刻的体会,具体使用情况还需要大家实践验证。这里是亿速云,小编将为大家推送更多相关知识点的文章,欢迎关注!
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