这篇文章主要介绍了RNAcentral是什么数据库，具有一定借鉴价值，感兴趣的朋友可以参考下，希望大家阅读完这篇文章之后大有收获，下面让小编带着大家一起了解一下。
RNAcentral是由EBI开发的一个非编码RNA数据库，整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多个数据库中的非编码RNA信息，旨在为ncRNA的研究提供一个统一的参照，网址如下
https://rnacentral.org/
目前最新版本为v10, 整合了来自miRBase v22和LNCipedia 5.0版本的最新数据，同时新增了reads mapping和GO 注释，示意如下
整合的所有数据库列表见如下链接
https://rnacentral.org/expert-databases
示意图如下
对于每一条非编码RNA的序列，RNAcentral会给出1个唯一的编号Unique RNA Sequence identifier，前缀为URS ，后面是10个数字和字母的组合，比如URS0000000001, URS00000478B7， URS编号符合 /URS[0-9A-F]{10}/ 正则表达式。
RNAcentral 提供了3种检索方式
通过text search这种检索方式，我们可以选择下列几种过滤方式，对数据进行筛选
筛选好之后，可以点击右上角进行下载
通过sequence search检索方式，我们可以对一条序列进行注释
输入一条fasta 序列，RANcentral 会使用 nhmmer 进行比对，将比对上的数据库中的序列输出，这样我们就可以对序列进行注释了，判断它是哪种非编码RNA。
该数据库提供了FTP和API服务，用于抓取数据，FTP的地址如下
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral
通过该数据库，我们可以方便的对各种ncRNA进行注释。
感谢你能够认真阅读完这篇文章，希望小编分享的“RNAcentral是什么数据库”这篇文章对大家有帮助，同时也希望大家多多支持亿速云，关注亿速云行业资讯频道，更多相关知识等着你来学习!
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