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统计数据,以及ggplot2绘图饼图代码如下:
library(reshape2) local({r <- getOption("repos") ;r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" ;options(repos=r)}) library(ggplot2) library(cowplot) library(RColorBrewer) pairjoinC <- function(x,y){ ran1=paste(paste(head(x,-1),"%",sep=""), paste(tail(x,-1),"%",sep=""), sep="-") ran1[length(ran1)]=">40%" ran1=paste(ran1," (",y,")",sep="") ran1 } # use the base hist() function to calculate BINs ,超过40%的统计到一起; data[data>40]=41 MassStatC <- with(hist(data, breaks=seq(0, 45, by = 5), plot=FALSE), data.frame(N=counts, Mass=pairjoinC(breaks,counts), PCT=counts/sum(counts))) MassStatC$Mass=factor(MassStatC$Mass, levels=rev(MassStatC$Mass), order=T) pe = ggplot(MassStatC, aes(x="", y= N, fill= Mass))+ geom_bar(stat="identity",width=1)+ coord_polar(theta="y")+ labs(x="", y="",title="Distribution of Protein's Sequence Coverages")+ theme(axis.ticks = element_blank(), axis.text.x = element_blank())+ scale_fill_brewer(palette="Paired",breaks = MassStatC$Mass, labels = as.character(MassStatC$Mass),direction=-1)+ geom_text(aes(x = 1.7, y = cumsum(MassStatC$N)-MassStatC$N/2 , label =paste( as.character(round(MassStatC$PCT*100,2)),"%",sep="")), show.legend = FALSE, color="black")+ theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5), legend.title = element_blank(), panel.background = element_rect(fill = "transparent",colour = NA), panel.grid.minor = element_blank(), panel.grid.major = element_blank(), axis.line= element_blank(), plot.background = element_rect(fill = "transparent",colour = NA)) pe
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