这篇文章主要讲解了“eggnog-mapper软件的安装配置方法”，文中的讲解内容简单清晰，易于学习与理解，下面请大家跟着小编的思路慢慢深入，一起来研究和学习“eggnog-mapper软件的安装配置方法”吧！
数据库文件下载链接
http://eggnogdb.embl.de/download/emapperdb-5.0.0/eggnog.db.gz http://eggnogdb.embl.de/download/emapperdb-5.0.0/eggnog_proteins.dmnd.gz
将数据库文件下载到data文件夹下
这次使用wget命令成功下载，试着运行软件自带数据成功
python emapper.py -i test/test_queries.fa --output out -m diamond --cpu 8
这个软件是python2版本的，使用之前我先创建了一个python2的虚拟环境
conda create -n emapper python=2.7
conda activate emapper
以上是使用diamond做注释，这个软件还可以使用hmmer做注释，印象里好像还得配置hmmer的数据库。而且这个数据库文件非常大，而且数据库文件有好几个，这里我先不尝试了。
同时这个软件还有一个在线版 http://eggnogdb.embl.de/#/app/emapper
在线版运行也很快，我之前试过两万多条蛋白序列，基本上一个晚上就能得到结果
软件的详细介绍
https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/83144768
感谢各位的阅读，以上就是“eggnog-mapper软件的安装配置方法”的内容了，经过本文的学习后，相信大家对eggnog-mapper软件的安装配置方法这一问题有了更深刻的体会，具体使用情况还需要大家实践验证。这里是亿速云，小编将为大家推送更多相关知识点的文章，欢迎关注！
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