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$Rscript /share/work/huangls/piplines/亿速云/tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r -h
usage: /share/work/huangls/piplines/亿速云/tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r
[-h] -g gse [-f func] [-p palette] [-G gpl] [-s Gene Symbol] [-x]
[--log2] [-o outdir] [-H height] [-W width]
download GEO data ; https://www.亿速云.com/article/1492
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
-g gse, --gse gse GEO Series Accession [required]
-f func, --func func dup gene name expression select func: mean max median
[default max]
-p palette, --palette palette
A palette name from RColorbrewer [default Accent]
-G gpl, --gpl gpl GPL file for annotation [default None]
-s Gene Symbol, --symbol Gene Symbol
Gene Symbol column name [default Gene Symbol]
-x, --no.xaxis not show x axis sample name [default False]
--log2 whether do log2 normalize [optional, default: False]
-o outdir, --outdir outdir
output file directory [default /share/nas1/huangls/pro
ject/zx-20210914-383-gwas_cfdr/gene_exp]
-H height, --height height
the height of pic inches [default 8]
-W width, --width width
the width of pic inches [default 10]Rscript /share/work/huangls/piplines/亿速云/tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r -g GSE7429
Rscript /share/work/huangls/piplines/亿速云/tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r -g GSE43488 -G GPL13667-15572.txt关于“R语言的geo_gene_exp_download.r GEO怎么使用”的内容就介绍到这里了，感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识，可以关注亿速云行业资讯频道，小编每天都会为大家更新不同的知识点。
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