这篇文章主要为大家展示了“Ubuntu+python如何将nii图像保存成png格式”，内容简而易懂，条理清晰，希望能够帮助大家解决疑惑，下面让小编带领大家一起研究并学习一下“Ubuntu+python如何将nii图像保存成png格式”这篇文章吧。
系统：Ubuntu 16.04
软件： python 3.5
先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。
import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
def read_niifile(niifile): #读取niifile文件
img = nib.load(niifile) #下载niifile文件（其实是提取文件）
img_fdata = img.get_fdata() #获取niifile数据
return img_fdata
def save_fig(file): #保存为图片
fdata = read_niifile(file) #调用上面的函数，获得数据
(x,y,z) = fdata.shape #获得数据shape信息：（长，宽，维度-切片数量）
for k in range(z):
silce = fdata[k,:,:] #三个位置表示三个不同角度的切片
imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
#将切片信息保存为png格式
dir = './.nii' #nii的路径
savepicdir = '' #保存png的路径
os.mkdir(savepicdir) #创建文件夹
save_fig(dir) #运行程序，保存为图像不要忘记返回img_fdata，否则下一个文件会报错。
以上是“Ubuntu+python如何将nii图像保存成png格式”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家都有了一定的了解，希望分享的内容对大家有所帮助，如果还想学习更多知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道！
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