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library(agricolae)
data(sweetpotato)可以看到, 数据为两列, 第一列为不同病毒的类型, 第二列为产量, 为了研究不同病毒感染对产量的影响.
> head(sweetpotato)
virus yield
1 cc 28.5
2 cc 21.7
3 cc 23.0
4 fc 14.9
5 fc 10.6
6 fc 13.1因素: virus
变量: yield
model<-aov(yield~virus, data=sweetpotato)
summary(model)可以看到不同病毒达到显著性水平.
> summary(model)
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
virus 3 1170.2 390.1 17.34 0.000733 ***
Residuals 8 179.9 22.5
---
Signif. codes:
0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1这里多重比较采用LSD方法.
out <- LSD.test(model,"virus", p.adj="bonferroni")
out$groups结果可以看到, oo, ff,cc之间不显著(都有a), oo,ff与fc之间显著(字母没有交集).
> out$groups
yield groups
oo 36.90000 a
ff 36.33333 a
cc 24.40000 ab
fc 12.86667 bplot(out)
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