这篇文章主要为大家展示了“Pacbio三代全长转录组中融合基因的示例分析”，内容简而易懂，条理清晰，希望能够帮助大家解决疑惑，下面让小编带领大家一起研究并学习一下“Pacbio三代全长转录组中融合基因的示例分析”这篇文章吧。
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq 3) 中融合基因的分析，可以采用Cupcake 中的“fusion_finder.py” 这个脚本来分析。
fusion_finder.py --input hq_isoforms.fastq --fq -s hq_isoforms.fastq.sorted.sam -o lq_isoforms.fasta.fusion --cluster_report_csv cluster_report.csv
参数说明：
hq_isoforms.fastq : 这个文件是在polish的结果中的hq fastq
hq_isoforms.fastq.sorted.sam : 这个是和基因组比对的sam
lq_isoforms.fasta.fusion: 这个是输出结果
cluster_report.csvZ: 这个是在cluster过程中的报告结果
以上是“Pacbio三代全长转录组中融合基因的示例分析”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家都有了一定的了解，希望分享的内容对大家有所帮助，如果还想学习更多知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道！
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