这篇文章主要介绍了Perl如何提取染色体序列指定范围的基因序列,具有一定借鉴价值,感兴趣的朋友可以参考下,希望大家阅读完这篇文章之后大有收获,下面让小编带着大家一起了解一下。
Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法:
$gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1);
其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的,所以要减1;$end是提取序列的结束位置;$gene是提取的指定位置的序列。
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